Fernando comienza a trabajar como montador hace más de una década y a partir de 2007, simultanea sus trabajos con sus propios proyectos como guionista y director. Entre ellos, los cortos Mensajes de voz y Tu(a)mor, así como The End y Les Variations Dielman, de corte más experimental. Todos ellos han tenido un exitoso recorrido en festivales de todo el mundo.
Su primer largometraje, La herida, ha recibido los Goya a la Mejor Dirección Novel y a la Mejor Actriz así como la Concha de Plata a la Mejor Actriz y una Mención Especial en el Festival de San Sebastián.
Actualmente está terminando su último proyecto: Morir.